Los rojinegros tuvieron un buen inicio de campaña en la Bundesliga bajo el mando del entrenador Reinhard Saftig. Después de 12 partidos, el Werkself ocupaba el segundo lugar a dos puntos del Bayern de Múnich, líder de liga. Una caída provocó que el Bayer 04 terminara en sexto lugar en la primera mitad de la temporada. Durante las vacaciones de invierno, el entonces director deportivo, Reiner Calmund, decidió traer a Dragoslav Stepanovic de Frankfurt como nuevo estratega para la próxima campaña.
En la segunda mitad de la temporada de la Bundesliga, el Werkself recogió siete de los 12 puntos posibles antes de enfrentarse al Eintracht Frankfurt en la semifinal de Copa del 30 de marzo. Mientras que Hertha Berlin Amateurs sorprendentemente venció a Chemnitz FC de segunda división en la otra semifinal, el Werkself y las Águilas se enfrentaron en igualdad de condiciones. El equipo dirigido por Saftig aseguró una convincente victoria de 3-0 sobre Eintracht. La dupla legendaria de Ulf Kirsten y Andreas Thom anotó los tres goles, para llevar a Leverkusen a la final en el Estadio Olímpico de Berlín.
Inmediatamente después del partido, el entrenador de Eintracht, Dragoslav Stepanovic, renunció a su cargo. Cinco semanas después, el director deportivo Calmund despidió a Saftig; entonces Stepanovic tomó el timón y el Werkself venció a Hertha Berlin Amateurs 1-0 - Kirsten anotó el gol en el minuto 77 - para levantar la Copa DFB por primera vez en la historia del club.
Estadísticas de la semifinal de la Copa DFB 1993
Frankfurt: Stein – Bindewald, Binz, Tskhadadze – Weber, Komljenovic (74' Studer), Bein, Falkenmayer (72' Yeboah), Bommer – Schmitt, Kruse
Bayer 04: Vollborn – Kree, Foda, Wörns – Stöver, Lupescu, Hapal, Fischer, von Ahlen (67' Scholz) – Thom, Kirsten (80' Tolkmitt)
Goles: 0-1 Thom (6'), 0-2 Kirsten (72'), 0-3 Thom (75')
Árbitro: Manfred Harder
Tarjetas amarillas: Tskhadadze, Schmitt – von Ahlen, Kirsten
Tarjetas rojas: Bindewald (55.)
Espectadores: 35.000 en el Waldstadion de Frankfurt

Desde la camiseta especial hasta pancartas de aficionados, todo giró en torno a los numerosos clubes de aficionados del Bayer 04 durante el partido en casa contra el 1. FSV Mainz 05. Por ello, no podía faltar un homenaje adecuado a los seguidores del Werkself durante el descanso del partido de la Bundesliga. Fernando Carro, director general de la Junta Directiva, homenajeó los 50 años de aniversario de seis clubes de aficionados frente a los banquillos del BayArena.
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Final emocionante: un gol en los últimos minutos le dio un punto al Bayer 04 en un partido en casa contra el 1. FSV Mainz 05, que estuvo dominado por los rojinegros después del descanso. A pesar de tener mucha posesión del balón, el Werkself no encontró muchos huecos al principio y se puso por detrás en el minuto 67 por un gol de Sheraldo Becker tras un contraataque del Mainz. En los últimos minutos, el Leverkusen se lanzó al ataque y logró el empate gracias a Jarell Quansah (88').
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Es una expresión de estrecha conexión y un homenaje a la singular cultura de los aficionados bajo la cruz: con la presentación de la «camiseta especial 50 años de clubes de aficionados», el Bayer 04 Leverkusen deja una huella muy especial. Con motivo de la fundación del «1. Fanclub 1976 Leverkusen», al que siguieron muchos otros en los años siguientes hasta la actualidad, el club de fútbol de la Bundesliga conmemora con la nueva camiseta 50 años de pasión vivida. Los altibajos, los éxitos celebrados juntos y las derrotas sufridas se manifiestan en esta prenda blanca, símbolo de una identificación inquebrantable con el Werkself.
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¡Mucho movimiento en el BayArena! El partido en casa contra el 1. FSV Mainz 05 está marcado por los numerosos clubes de aficionados del Bayer 04, cuyo nacimiento —la fundación del «1. Fanclub 1976 Leverkusen»— se remonta a hace 50 años. Por ello, varios representantes de los clubes de fans participarán en los homenajes, una acción con pancartas o una charla en el descanso, y el Werkself jugará con la camiseta especial blanca del club de fans. Además, durante el descanso del partido, el alcalde Stefan Hebbel y la campeona mundial de lanzamiento de jabalina Steffi Nerius, entre otros, hablarán sobre la candidatura olímpica con la participación de Leverkusen. Nuestras pinceladas previas.
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