Los rojinegros tuvieron un buen inicio de campaña en la Bundesliga bajo el mando del entrenador Reinhard Saftig. Después de 12 partidos, el Werkself ocupaba el segundo lugar a dos puntos del Bayern de Múnich, líder de liga. Una caída provocó que el Bayer 04 terminara en sexto lugar en la primera mitad de la temporada. Durante las vacaciones de invierno, el entonces director deportivo, Reiner Calmund, decidió traer a Dragoslav Stepanovic de Frankfurt como nuevo estratega para la próxima campaña.
En la segunda mitad de la temporada de la Bundesliga, el Werkself recogió siete de los 12 puntos posibles antes de enfrentarse al Eintracht Frankfurt en la semifinal de Copa del 30 de marzo. Mientras que Hertha Berlin Amateurs sorprendentemente venció a Chemnitz FC de segunda división en la otra semifinal, el Werkself y las Águilas se enfrentaron en igualdad de condiciones. El equipo dirigido por Saftig aseguró una convincente victoria de 3-0 sobre Eintracht. La dupla legendaria de Ulf Kirsten y Andreas Thom anotó los tres goles, para llevar a Leverkusen a la final en el Estadio Olímpico de Berlín.
Inmediatamente después del partido, el entrenador de Eintracht, Dragoslav Stepanovic, renunció a su cargo. Cinco semanas después, el director deportivo Calmund despidió a Saftig; entonces Stepanovic tomó el timón y el Werkself venció a Hertha Berlin Amateurs 1-0 - Kirsten anotó el gol en el minuto 77 - para levantar la Copa DFB por primera vez en la historia del club.
Estadísticas de la semifinal de la Copa DFB 1993
Frankfurt: Stein – Bindewald, Binz, Tskhadadze – Weber, Komljenovic (74' Studer), Bein, Falkenmayer (72' Yeboah), Bommer – Schmitt, Kruse
Bayer 04: Vollborn – Kree, Foda, Wörns – Stöver, Lupescu, Hapal, Fischer, von Ahlen (67' Scholz) – Thom, Kirsten (80' Tolkmitt)
Goles: 0-1 Thom (6'), 0-2 Kirsten (72'), 0-3 Thom (75')
Árbitro: Manfred Harder
Tarjetas amarillas: Tskhadadze, Schmitt – von Ahlen, Kirsten
Tarjetas rojas: Bindewald (55.)
Espectadores: 35.000 en el Waldstadion de Frankfurt

Un galardón especial para un compromiso social excepcional: en la entrega de los premios Sepp Herberger de este año, celebrada el lunes por la noche en la ciudad de Wolfsburgo, la Fundación Sepp Herberger de la DFB ha premiado al Bayer 04 en la categoría de reinserción social. El club de la Bundesliga recibió el premio, dotado con 12 000 euros, por su gran compromiso con los reclusos, especialmente en el centro penitenciario de Wuppertal-Ronsdorf.
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Tras el pitido final del empate 1-1 contra el Bayern de Múnich, los aficionados del Bayer 04 tuvieron que tomarse un respiro en el BayArena, por un lado debido a su ruidoso apoyo, una vez más, y por otro, por el gran espectáculo vivido sobre el terreno de juego: tres goles anulados, dos expulsiones y un Werkself que «volvió a cuajar una muy buena actuación ante un fuerte rival», como valoró posteriormente el entrenador Kasper Hjulmand. El danés se mostró además entusiasmado con la actuación del joven Montrell Culbreath, titular en el once inicial. Patrik Schick, por su parte, pudo celebrar su partido número 200 con la camiseta del Werkself. El análisis del partido.
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Tras el empate 1-1 ante el FC Bayern en la 26ª jornada de la Bundesliga 2025/26, algunos protagonistas del Bayer 04 atendieron a los medios. Las reacciones del partido.
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En la 26ª jornada de la Bundesliga 2025/26, el Werkself firmó otro empate ante un rival de primer nivel, esta vez frente al FC Bayern de Múnich. Aleix Garcia adelantó a los combativos de Leverkusen en el minuto 6. Tras la tarjeta roja a Nicolas Jackson (42'), los rojinegros jugaron con superioridad numérica, pero en el minuto 70 encajaron el empate, obra de Luis Diaz. El propio Diaz vio poco después la segunda amarilla y, a partir de ahí, el Bayer 04 encerró de nuevo al Bayern en su propia área, aunque dejó escapar varias ocasiones claras para volver a ponerse por delante. Así, el Werkself suma ya cuatro partidos consecutivos de liga en casa sin perder ante el Bayern, aunque esta vez mereció claramente la victoria.
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El FC Bayern München avanza con paso firme hacia el título de la Bundesliga con una ventaja de once puntos sobre su más inmediato perseguidor. Pese al dominio que el FC Bayern viene mostrando, últimamente ha dejado a la vista una debilidad; la misma que el Bayer 04 ya supo aprovechar para sacar un buen resultado ante el Arsenal (1-1) en la Champions esta semana. Una victoria o un empate el sábado por la tarde permitiría al Leverkusen mantener su condición de invicto en su cuarto partido consecutivo en casa contra el Bayern en la Bundesliga. Los aficionados del Leverkusen que asistan al partido y deseen apoyar una buena causa antes del encuentro podrán participar en la campaña en beneficio de Tafel Leverkusen e.V. (Banco de Alimentos de Leverkusen). Además, la jornada estará dedicada a la candidatura olímpica de la región «KölnRheinRuhr», y los alcaldes de Leverkusen y Colonia, entre otros, ofrecerán información durante el descanso.
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